La nueva tecnología permite la secuenciación rápida de genomas completos de patógenos vegetales – ScienceDaily

La tecnología de secuenciación de próxima generación ha facilitado más que nunca el diagnóstico rápido de enfermedades de las plantas. «Es realmente emocionante ver cómo han evolucionado las tecnologías de secuenciación y cómo esta nueva tecnología facilita la secuenciación de genomas completos en tan poco tiempo», dijo Yazmín Rivera, patólogo de plantas del programa de Cuarentena y Protección Vegetal del Departamento de Agricultura de los Estados Unidos. quien publicó recientemente un artículo de investigación sobre la eficacia de los protocolos de Oxford Nanopore Technologies.

«Queríamos proporcionar una evaluación imparcial de la tecnología y los protocolos disponibles para la secuenciación de lecturas largas», explicó Rivera. Junto con otros fitopatólogos, Rivera utilizó los protocolos de la compañía para preparar bibliotecas de ARN y ADN a partir de material vegetal infectado por virus y de una bacteria patógena de plantas, respectivamente. Después de una hora de secuenciación de datos, los científicos tenían datos suficientes para ensamblar pequeños genomas.

«Los diagnosticadores agradecerán una revisión objetiva de esta tecnología», dijo Rivera. Rivera y sus colegas publicaron sus hallazgos en Progreso en sanidad vegetal, presentando una comparación en paralelo de los protocolos que permitirá al lector identificar qué kit de preparación de bibliotecas se adapta mejor a sus necesidades.

La capacidad de obtener rápidamente el genoma completo de un organismo tiene grandes implicaciones para el campo de la patología vegetal. «Tener más información disponible facilita la identificación de patógenos emergentes y de patógenos que son difíciles de identificar», explica Rivera. Para obtener más información, lea «Comparación de protocolos de secuenciación de nanoporos y análisis en tiempo real para el diagnóstico de fitopatógenos» publicado en la edición de marzo de Plant Health Progress.

Descargo de responsabilidad: La mención de nombres comerciales o productos comerciales en esta publicación es únicamente para proporcionar información específica y no implica recomendación ni aprobación por parte del Departamento de Agricultura de EE. UU.

Fuente de la historia:

Materiales proporcionado por Sociedad Americana de Fitopatología. Nota: El contenido puede editarse por estilo y longitud.